Nueva York está en peligro debido a que Shredder y su compinche El Clan del Pie dominan la ciudad y ejercen un férreo control sobre todo. Pero con la ayuda de la reportera April y su compañero Vern Fenwick, cuatro tortuga mutados (Leonardo, Michelangelo, Donatello y Raphael) saldrán de las alcantarillas e intentarán salvar la ciudad.